Authors: Li H, Li S, Zhang H, Gu J, Dai Y, Wu R, Wang Y, Han R, Sun G, Zhang Y, Li H, Zhao Y, Li G,
(Contact: zhaoyl7322@126.com ) Affiliation: The Shennong Laboratory, Henan Agricultural University, Zhengzhou, Henan, China Title: Integrated GWAS and transcriptome analysis reveals key genes associated with muscle fibre and fat traits in Gushi chicken Journal: British Poultry Science, 66(1):31-41 (2025)
DOI :
10.1080/00071668.2024.2400685 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Intramuscular fat percentage
Chr.1 : Asso:311938 , Asso:311941 , Asso:311950 , Asso:311956 , Asso:311963 , Asso:311966 , Asso:311967 , Asso:311968 , Asso:311974 , Asso:311976 , Asso:311977 , Asso:311980 , Asso:311981 , Asso:311982 , Asso:311983 . Chr.2 : Asso:311946 , Asso:311955 , Asso:311965 . Chr.3 : Asso:311945 , Asso:311948 , Asso:311951 , Asso:311960 , Asso:311962 , Asso:311964 . Chr.5 : Asso:311939 , Asso:311940 , Asso:311943 , Asso:311952 , Asso:311975 , Asso:312014 , Asso:312019 . Chr.6 : Asso:311942 , Asso:311979 . Chr.9 : Asso:311953 . Chr.11 : Asso:311947 . Chr.13 : Asso:311944 , Asso:311958 , Asso:311961 , Asso:311969 , Asso:311970 , Asso:311971 , Asso:311972 , Asso:311973 . Chr.15 : Asso:311959 . Chr.20 : Asso:311954 , Asso:311978 . Chr.26 : Asso:311957 . Chr.33 : Asso:312015 , Asso:312016 , Asso:312017 , Asso:312018 , Asso:312020 .
QTL for Muscle fiber density
Chr.1 : Asso:312004 , Asso:312013 . Chr.2 : Asso:311993 , Asso:311994 , Asso:311998 , Asso:312001 , Asso:312003 , Asso:312005 , Asso:312006 , Asso:312008 , Asso:312009 , Asso:312012 . Chr.3 : Asso:311996 , Asso:311997 , Asso:311999 . Chr.5 : Asso:311991 . Chr.7 : Asso:311995 . Chr.9 : Asso:312007 . Chr.10 : Asso:311992 . Chr.11 : Asso:312010 , Asso:312011 . Chr.18 : Asso:312000 , Asso:312002 , Asso:312022 . Chr.27 : Asso:311949 .
QTL for Muscle fiber diameter
Chr.1 : Asso:311986 . Chr.3 : Asso:311985 . Chr.9 : Asso:311987 . Chr.27 : Asso:311984 , Asso:311988 , Asso:311989 , Asso:311990 , Asso:312021 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (18) ,
Chr.2 (13) ,
Chr.3 (10) ,
Chr.5 (8) ,
Chr.6 (2) ,
Chr.7 (1) ,
Chr.9 (3) ,
Chr.10 (1) ,
Chr.11 (3) ,
Chr.13 (8) ,
Chr.15 (1) ,
Chr.18 (3) ,
Chr.20 (2) ,
Chr.26 (1) ,
Chr.27 (6) ,
Chr.33 (5) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Li H, Li S, Zhang H, Gu J, Dai Y, Wu R, Wang Y, Han R, Sun G, Zhang Y, Li H, Zhao Y, Li G, (2025). Integrated GWAS and transcriptome analysis reveals key genes associated with muscle fibre and fat traits in Gushi chicken. British poultry science, 66(1):31-41;
Curated into QTLdb on 2024-11-07. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=ImEm5P2BmW
OR
Li H, Li S, Zhang H, Gu J, Dai Y, Wu R, Wang Y, Han R, Sun G, Zhang Y, Li H, Zhao Y, Li G, (2025). Integrated GWAS and transcriptome analysis reveals key genes associated with muscle fibre and fat traits in Gushi chicken. British poultry science, 66(1):31-41; DOI: https://dx.doi.org/10.1080/00071668.2024.2400685
